حضرت آیتالله خامنهای رهبر معظم انقلاب اسلامی در دیدار اعضای شورای عالی حوزه های علمیه سراسر کشور با اشاره به منزلت و جایگاه این شورا در تربیت روحانیون و علمای تأثیرگذار بر ضرورت جدی گرفتن تحول در حوزه های علمیه و زنده کردن ظرفیت های درونی آن، و ارتقاء سطح اخلاق، فکر و معرفت دینی طلاب تأکید کردند.
رهبر انقلاب اسلامی مبنای اصلی کار در حوزه های علمیه را تربیت فقیه خواندند و خاطرنشان کردند: لازم است در کنار توجه به این مبنای اصلی به آموزش و فراگیری علوم عقلی اعم از فلسفه و کلام نیز اهتمام شود.
ایشان «روح» حاکم بر حوزه های علمیه را تربیت علمای وارسته دانستند و در تبیین لوازمِ «صورت و قالبِ» فعالیت های حوزه های علمیه، بر مواردی همچون پرهیز از تقلید روشهای مدیریتی دیوان سالارانه، گسترش تشکیلات اداری، موازی کاری و مدرک گرایی تأکید کردند.
رهبر انقلاب تقویت سطح علمی و آموزشی در حوزه های علمیه را ضرورتی قابل توجه دانستند و تصریح کردند: لازم است شورای عالی حوزه های علمیه در این زمینه برنامه ریزی کند.
پیش از بیانات رهبر معظم انقلاب اسلامی، ابتدا آیتالله استادی رئیس شورایعالی حوزه علمیه و سپس حضرات آقایان مقتدایی، غروی و حسینی بوشهری گزارشی را از اقدامات دوره گذشته مدیریت حوزه و مصوبات و سیاست گذاری های شورایعالی و برنامه های مدیریت در دوره پیش رو بیان کردند.